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Gene Runner 是一款專業(yè)實(shí)用的生物基因分析工具。它能夠幫助實(shí)驗(yàn)室工作人員的基因進(jìn)行數(shù)據(jù)模擬分析,讓數(shù)據(jù)能夠可視化提供我們查看,支持多種序列分析,您可以在一個(gè)界面上模擬不同組的序列,利用顏色以及圖形的方式區(qū)別基因組的變化過程。
Gene Runner軟件允許你搜索序列或蛋白質(zhì)相匹配的全部或部分的當(dāng)前文件的多個(gè)在線數(shù)據(jù)庫。另外,你可以搜索軟件的starblast服務(wù)器,與NCBI的BLAST或文本服務(wù)器。執(zhí)行任何應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)搜索菜單Gene Runner軟件在線搜索。
你可以開始一個(gè)Editseq項(xiàng)目空或空白文檔,或者你可以從各種格式的文件,打開一個(gè)現(xiàn)有的序列。如果序列文件長于需要,可以通過坐標(biāo)指定序列的子范圍。
你也可以從一個(gè)數(shù)據(jù)庫訪問Internet或Intranet輸入序列,如DNASTAR的starblast或NCBI的Entrez數(shù)據(jù)庫。
Editseq顯示DNA或蛋白質(zhì)序列和相關(guān)的評(píng)論和特點(diǎn)三可調(diào)的窗格。進(jìn)入一個(gè)新的序列,輸入適當(dāng)?shù)腎ub核苷酸或蛋白質(zhì)編碼。一旦你輸入了一個(gè)序列,你可以選擇將殘基分成三胞胎,十列,或者你選擇的另一組。檢查精度的順序使用Editseq的校對(duì)和語音驗(yàn)證功能。
Editseq的搜索功能讓你找到位置,開放閱讀框的瞬間。此外,還可以對(duì)序列的任何部分或部分進(jìn)行反轉(zhuǎn)、補(bǔ)充或查看統(tǒng)計(jì)信息。您也可以翻譯DNA序列或反向翻譯蛋白質(zhì)序列使用定制,表達(dá)特定的遺傳密碼。
你可以寫寫序列的任何意見直接進(jìn)入的Editseq窗口中間窗格。默認(rèn)情況下,當(dāng)打開序列時(shí),將在下窗格中顯示。您也可以創(chuàng)建自己的注釋,帶或不帶翻譯,并在一個(gè)共同的標(biāo)題和描述下連接幾個(gè)功能。
基因的運(yùn)動(dòng)員是專業(yè)的應(yīng)用旨在提供遺傳學(xué)家和生物學(xué)家提供一個(gè)可靠的工具,可以幫助他們輕松地進(jìn)行基因分析。
發(fā)現(xiàn)限制性位點(diǎn)
酶限制圖方法位于更多方法菜單中,使您能夠創(chuàng)建限制性映射。
在確定限制位點(diǎn)后,可以通過選擇瓊脂糖凝膠模擬命令來預(yù)測(cè)瓊脂糖凝膠的限制性片段的電泳分離。在查看模擬凝膠時(shí),您可以將光標(biāo)移到任何片段上,以顯示其范圍、大小和限制切割每個(gè)末端的限制酶的頭。
應(yīng)用程序需要的格式文件所包含的遺傳信息,然后可以使用“ORF分析”(開放閱讀框)按鈕,可以讓用戶設(shè)置優(yōu)先核苷酸或氨基酸的大小,以及選擇工作表的翻譯。開放的ORF的項(xiàng)目后,用戶可以對(duì)每個(gè)條目進(jìn)行各種注釋。
矩陣模式
這種方法,位于更多的方法部分,發(fā)現(xiàn)序列特征,如起始位點(diǎn),剪接受體位點(diǎn)和剪接供體位點(diǎn)。矩陣模式是在單獨(dú)的數(shù)據(jù)文件中定義,Gene Runner軟件\矩陣式文件夾(MAC)。而由密碼子預(yù)測(cè)方法確定的起始密碼子是簡單框架ATGs,矩陣模式方法考慮局部序列與預(yù)測(cè)功能的子集為ATGS起始密碼子的目的。
允許你同步更新兩個(gè)工作在相同的文件在任何或所有五lasergene應(yīng)用在同一時(shí)間。這樣的變化在一個(gè)應(yīng)用程序?qū)⒆詣?dòng)應(yīng)用的兩個(gè)相同的共享數(shù)據(jù)的其他應(yīng)用程序。
開放和節(jié)省開允許你在任何序列文件的命名和保存應(yīng)用以上文件的格式,這是usable市“任何的其他應(yīng)用程序。
“限制性分析”功能的基因流道,用戶只需檢查的序列的一部分,通過進(jìn)入優(yōu)選的切位點(diǎn)。此外,他們可以分析所有的酶的類型或復(fù)發(fā)/非回文。此功能還提供了用戶設(shè)置一個(gè)精確的分析區(qū)域和丟棄出挑的選項(xiàng)。
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